Отметим, что для «Мостоотряда-99» саратовский аэропорт легким объектом не назовешь. Помимо нашумевшей истории с дефектами взлетно-посадочной полосы, дагестанская компания имела еще и суды с заказчиком - Федеральным агентством воздушного транспорта (ФАВТ) в лице ФГУП «Администрация гражданских аэропортов (аэродромов)» (ФГУП АГА) на весьма внушительные суммы.В 2017 году ФАВТ предъявил генподрядчику неустойку на 88,8 млн рублей за нарушение сроков выполнения предписаний на устранение неких нарушений. Предписания были выданы в 2016 году, их суть в материалах дела, рассмотренного арбитражным судом Москвы, не раскрывается. В 2018 году столичный арбитраж снизил сумму претензий до штрафа для компании в размере 400 тысяч рублей. Это решение устояло во всех инстанциях арбитража, куда обратилось с жалобами ФАВТ. А вот второе дело кончилось для «Мостоотряда-99» не столь однозначно. В том же в 2017 году ФАВТ предъявил к генподрядчику неустойку уже на 127 млн рублей за срыв сроков исполнения госконтракта. Материалы дела позволяют оценить объем нестыковок, переделок проекта, с которыми пришлось столкнуться исполнителю. Так, заказчик взыскивал с «Мостоотряда-99» неустойки за не проложенные вовремя кабельные переходы под взлетно-посадочной полосой, нарушение графика строительства патрульной дороги, которое произошло из-за не засыпанного в нужный срок оврага, а для этого следовало в свою очередь, отвести участок дороги Швыревка-Сабуровка. А при заказе трансформаторных подстанций обнаружилось, что проектировщик из Санкт-Петербурга заложил в проект уже не существующее оборудование. При обустройстве периметрового ограждения площадки подрядчик также столкнулся с дефектами проектной документации, пришлось переделывать и проект здания КДП, так как обнаружилось, что здание требует на 30% больше арматуры, чем полагали разработчики. Весьма неприятное открытие ждало на земляных работах под объектом «Перрон». Из-за того, что последние работы на земляном полотне производились за полтора года до прихода АО «Мостоотряд-99», грунтовое основание разуплотнилось, так что пришлось срочно менять грунты. Кроме того, все изменения в проект ФГУП «АГА (а)» согласовывал с паузой в 3-6 месяцев, а то и дольше. В итоге московский арбитраж в 2018 году подтвердил претензии заказчика на сумму всего лишь 3,4 млн рублей. Это решение не было оспорено сторонами и вступило в законную силу.
Однако главный трэш на суперобъекте «Гагарин» был связан не с этими, небольшими, в общем-то вопросами, а с взлетно-посадочной полосой, где, как заявил сам подрядчик, обнаружилась трещина на участке длиной 600 метров. Посетивший в 2018 году объект глава Росавиации Александр Нерадько заявлял, что дефектный участок будет заменен полностью.В конце того же года Главгосэкспертиза выдала невразумительное заключение об отсутствии претензий к проектам строительства первой очереди аэропорта. Речь, возможно, шла именно о корректировках первоначального замысла. По версии генподрядчика, причина появления трещин - в отсутствии сети скважин для мониторинга состояния грунтов. Эти скважины были даже не запроектированы, а проглядел эту важную часть проекта заказчик – все та же Росавиация в лице ФГУП «Администрация гражданских аэропортов (аэродромов)».