На посту заммэра Никитин принимал участие в процедуре передачи «Саратовводоканала» в концессию. Ныне это соглашение расторгнуто, проект считается провалившимся.В 2018 году, уже в бытность главой города Михаила Исаева, СУ СКР потребовал от него увольнения Никитина с поста. Основанием стало уголовное дело в отношении супруги чиновника, экс-замглавы администрации Фрунзенского района Елены Никитиной, которую обвиняли в злоупотреблении полномочиями и препятствовании деятельности бизнеса, в частности утверждалось, что она требовала деньги у предпринимателей под предлогом строительства церкви. Само дело выглядело беспрецедентно скандальным. В частности, Алексей Никитин заявлял, что в январе 2018 года следователь увез его супругу аж из реанимационного отделения больницы, несмотря на протесты врачей. Дело завершилось в 2019 году, Никитину освободили в зале суда, засчитав ей все время, проведенное под арестом. Вины своей она не признала. Последние данные о доходах чиновника датируются 2021 годом. Тогда он заработал 4,374 млн. рублей. Также г-ну Никитину принадлежали 2 земельных участка по 1200 кв. метров, и на 300 квадратов - в долевой собственности. Жилой дом с террасой на 491.7 кв. м, а также 4 квартиры (32.4 кв. м, 63.1 кв. м, 117.9 кв. м и 181 кв. м) в пользовании, оформленные на его супругу. В собственности семьи находился автомобиль Volkswagen Touareg. Работа в мэрии, похоже, отнимала у Алексея Никитина много сил. В марте 2023 года он угодил в больницу с гипертоническим кризом. Как утверждали коллеги чиновника, он очень переживал за свою работу. Если Роман Бусаргин ценит своего нового советника, ему стоит поберечь его нервы.